Choroba afektywna dwubiegunowa jest chorobą trwającą całe życie, dlatego wymaga leczenia przez całe życie, nawet jeśli chory czuje się dobrze. Leczenie jest zwykle prowadzone przez psychiatrę lub innego specjalistę w zakresie zdrowia psychicznego wyszkolonego w leczeniu choroby afektywnej dwubiegunowej. Leczenie może obejmować połączenie leków, terapii i innych metod leczenia, które mogą być konieczne, takich jak rehabilitacja po nadużywaniu substancji.
Psychiatrzy zazwyczaj zalecają leki jako początkowe leczenie, aby zrównoważyć nastrój i jak najszybciej opanować objawy. Po opanowaniu objawów konieczne jest leczenie podtrzymujące, aby długoterminowo leczyć chorobę afektywną dwubiegunową. Leczenie podtrzymujące jest bardzo ważne; bez niego ryzyko nawrotu jest większe i istnieje większa szansa, że niewielkie wahania nastroju mogą przekształcić się w pełną manię lub depresję.